在杭州注冊醫療器械銷售公司的流程主要包括以下步驟：

一、前期準備

1. 確定公司類型：可以是有限責任公司、股份有限公司等，需明確公司的組織形式、管理結構和運營規則。

2. 準備資金證明：提供足夠的資金證明，確保公司的正常運營。

3. 確定法定代表人：提供法定代表人的身份證明文件。

4. 準備醫療器械產品清單：列出公司計劃銷售或經營的醫療器械產品。

二、工商注冊流程

1. 名稱預先核準：向工商局提交申請，辦理《企業名稱預先核準通知書》，通常需要5個工作日。

2. 驗資報告：在銀行開立臨時賬戶，股東出資，并由會計師事務所出具驗資報告，一般需要3~5個工作日。

3. 辦理營業執照：提交相關資料，包括公司章程、法定代表人身份證明、股東信息等，辦理營業執照，通常需要7~10個工作日。

4. 刻制公章：在取得營業執照后，需要在工商局指定的地方刻制公司公章、財務章、法人章等。

三、醫療器械經營許可證辦理

1. 現場檢查準備：根據國家醫療器械企業現場檢驗的要求，建立和完善企業組織結構，進行醫療器械法規培訓和實際操作培訓。同時，查驗企業硬件狀況，制定硬件整改計劃和工程設計方案。

2. 安裝管理系統：協助企業完成質量管理系統文件編制，安裝相應的管理軟件系統。

3. 提交申請材料：準備并提交備案材料，包括醫療器械生產企業資格證明、適用的產品標準、醫療器械說明書、產品注冊檢測報告（適用于第二、三類醫療器械）、臨床試驗資料（根據產品情況而定）、產品質量保證書等。

4. 現場檢查與審批：藥監局將預約并察看經營場地，審核提交的書面申請材料。審核通過后，將頒發《醫療器械經營企業許可證》，通常需要30個工作日。

四、后續手續

1. 辦理組織機構代碼證：在質監局辦理組織機構代碼證，通常需要1~3個工作日。

2. 稅務登記：取得營業執照后，需要在30天內到當地稅務局辦理稅務登記，通常需要7~10個工作日。

3. 銀行開戶：在銀行開立基本賬戶，用于公司的日常經營和資金往來，通常需要7~10個工作日。

五、其他注意事項

1. 合規經營：在取得《醫療器械經營企業許可證》后，公司應嚴格按照相關法律法規和規定進行經營，確保產品質量和安全。

2. 持續監管：藥監部門將對醫療器械經營公司進行持續的監管和檢查，公司應積極配合并接受檢查。

總的來說，在杭州注冊醫療器械銷售公司需要遵循一系列嚴格的流程和要求。創業者應提前了解相關法律法規和政策要求，做好充分的準備和規劃，以確保注冊過程的順利進行和公司的合法合規經營。